淀粉则为多糖结构，水解成小分子脂肪酸所需的时间长，并且在水中的溶解性差，不易完全溶于水，容易造成残留和污泥絮体偏多等问题。
采用三水醋酸钠作为外加碳源可以解决低碳高氮污水中碳源不足的问题，反硝化污泥进行了长期驯化，然后利用缓冲溶液将反硝化过程中PH值的上升幅度控制在0.5范围内，提高反硝化阶段的脱氮水平，在很多污水处理厂得到了广泛应用，并取得了良好的效果。
甲醇为碳源时，理想的投加量碳氮比大于5时，反硝化才能完全进行，硝态氮去除率可达到95%，产泥率在0.35左右。但是甲醇不能被所有细菌硝化，反应时间缓慢，而且甲醇具有毒性，对人体有低毒，高度易燃，其蒸气与空气混合，可形成爆炸性混合物，有火灾的危险性，对于一些用地限制的污水处理厂或已建污水厂扩建工程来说，醋酸钠更适合作为外加碳源。